warpsharp.dllをダウンロードして、
C:\Program Files\AviSynth 2.5\plugins\
に入れる。(デフォルト) ds_input.auiをiniと一緒に適当な場所に置く。 携帯動画変換君の中のcoresフォルダにAVS_Skelton2.avsというファイルを作成する。 メモ帳等のテキストエディタで開いて、
LoadPlugin("C:\Program Files\AviSynth 2.5\plugins\warpsharp.dll") 
LoadAviUtlInputPlugin("D:\soft\動画\aviutl\ds_input.aui", "DSInput") 
DSInput("<%InputFile%>") 
return last
↑をコピー&ペーストして保存。
D:\soft\動画\aviutl\
の部分は環境によって違うので変更する。 携帯動画変換君フォルダ内の3GP_Converter.iniを テキストエディタで開いて
Ext3=WMV:\cores\AVS_Skelton2.avs
を追加する。 Ext*の部分は現在既にある設定によって変える。 既にExt3があるならExt4という感じで。 それと、既にExt0=WMVのように WMVに関して記述してある部分があった場合はその行を消して下さい。 にゃおでぃお - DownloadsからDirectShowSource with ConvertFPSをダウンロードして下さい。 中身のDirectShowSource.dllをC:\Program Files\AviSynth 2.5\pluginsに上書きして下さい。 これで携帯動画変換君でWMVが変換出来るようになりました。

参考サイト ソースの入力にAviSynthを利用する - PspWiki

デジタル家電系日記 携帯動画変換君でWMVを変換出来るようにする。